整个系统由三层网络构成：管理系统、中央监控系统、现场设备控制站。管理系统、中央监控系统通过以太网相连，中央监控系统、现场设备控制站通过工业以太网进行数据交换。
管理系统由应用服务器、生产管理及办公计算机、调度及信息发布控制计算机、网络交换机、打印机、网络接入设备等组成。
中央监控系统由两台互为热备的监控计算机、投影仪系统、三台中央服务器、工程师站计算机、打印机、通讯前置机、工业网络交换机组成。
根据工艺特点和构筑物的平面布置，共设5个现场控制站：
预处理控制站（PLC1）
二级处理控制站（PLC2）
加氯加药控制站（PLC3）
泥沙处理控制站（PLC4）
加压泵房控制站（PLC5）
五个控制站的控制系统全部采用南大傲拓自主研发的NA-400系列PLC和NA-VIEW触摸屏，所有PLC和HMI均支持工业以太网，通过工业交换机接入厂级光纤环网，与I/O服务器、报警/历史数据服务器、工程师站计算机通讯。工业以太网的优点在于通讯距离远、传输速度快、抗干扰能力强。
现场的各种水泵、阀门、仪表等通过I/O模块采集、控制，I/O模块分为开关量输入/输出模块、模拟量采集模块（电流/电压/热电偶/热电阻）、模拟量输出模块（电流/电压）、高速计数模块（脉冲采集）。有些带串口通讯的设备像电磁流量计、变频器等，也可以通过CMM串口通讯模块读写数据（流速/累计流量、变频器频率设定/反馈等）。
本工程自动控制系统安全、实用、经济、高效，能达到当前水厂自动化先进水平。水厂自动监测控制系统遵从“集中管理、分散控制、数据共享”的原则，系统各部分有相对独立性；并可利用网络技术完成系统的纵向与横向扩展；检修系统的任一部分，不会影响其它部分的正常运行。
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